Veronica comincia ad uscire con Logan Echolls alla fine della prima stagione. Mentre usciva con Leo D'Amato, Veronica aveva baciato Logan per ringraziarlo di averlo salvato da un possibile sequestratore, in realtà un agente dell'ATF. Il loro bacio era diventato qualcosa di più quando Logan l'aveva stretta in un abbraccio appasionato. Nessuno dei due poteva ignorare la loro alchimia e così avevano cominciato ad uscire insieme segretamente sotto il naso degli amici degli 09ers di Logan.
La loro relazione sembra andare in frantumi quando viene rivelato che Logan aveva fornito il GHB alla festa di Shelly Pomroy a causa del quale Veronica era stata drogata e stuprata. Per qualche tempo Veronica sospetta persino che sia Logan il suo violentatore. Quando scopre la verità, la loro relazione riprende il cammino iniziato. La loro relazione viene svelata agli 09ers durante un party dato da Aaron Echolls in onore di Logan. Allo stesso party, Veronica scopre delle telecamere posizionate sopra al letto della casa della piscina di Logan e decide di andarsene. Ben presto Veronica scopre che Logan non ha un alibi per il giorno in cui Lilly fu uccisa e ha paura che possa essere lui il colpevole.
Veronica scopre che le telecamere posizionate sopra al letto sono state utilizzate dal padre di Logan, Aaron Echolls, e scopre che Aaron uccise Lilly dopo che la ragazza aveva rubato le cassette che dimostravano gli atti sessuali tra i due. La notte che Aaron viene arrestato per l'assassinio di Lilly, Logan si presenta a casa di Veronica gravemente ferito dai PCHers. Veronica rimane al suo fianco durante il processo per l'omicidio di Felix Toombs, del quale Logan è accusato. Sebbene Logan venga assolto, il suo comportamento durante l'estate diventa irregolare sia a causa del suo processo sia perchè ha scoperto che suo padre aveva una relazione con Lilly e l'ha uccisa.
Logan e gli altri 09ers cominciano una guerra con i PCHers e Veronica teme per la vita del suo ragazzo. Decide così di lasciarlo senza però ferirlo ma Logan diventa violento viene cacciato fisicamente dalla casa di Veronica da suo padre. Logan cova rancore nei confronti di Veronica per la maggior parte della seconda stagione, specialmente quando la ragazza torna insieme a Duncan.
Col proseguire della stagione però, Logan rivela a Veronica di sentire ancora qualcosa per lei e pensa che il loro amore sia 'epico'. Veronica ritorna da lui la mattina dopo avergli rivelato i suoi sentimenti, solo per scoprire che il ragazzo non ricorda cosa lei gli aveva detto e che la notte prima ha dormito con la sua vecchia fiamma Kendal Casablancas. Durante il confronto con Cassidy Casablancas sul tetto del Neptune Grand, è a Logan che Veronica telefona per chiedere aiuto.
In seguito, i due ricominciano la loro relazione. All'inizio della terza stagione, entrambi cominciano l'Hearst College. La loro relazione sembra andare per il verso giusto, ma Veronica ha scoperto diverse cose riguardo a Logan dell'ultimo anno e scopre di non potersi più fidare del ragazzo. Sebbene lo disprezzi poichè le ha rivelato che lui e Mercer hanno lasciato a Tijuana un motel in fiamme senza aiutare le persone a scappare, lei capisce i suoi veri sentimenti per il ragazzo quando lui accore in suo aiuto dopo che lei è stata drogata dal violentatore della Hearst.
Logan, non sopportando che Veronica si trovi in costante pericolo, prova a convincere la ragazza ad abbandonare la sua investigazione sullo stupratore e anche di avere una guardia del corpo che la segue costantemente senza però la sua conoscenza. Sebbene loro affrontino insieme i loro problemi e ammettino di amarsi l'un l'altro, Logan rompe con Veronica nel nono episodio. Il ragazzo dice che non possono stare insieme poichè nessuno dei due può cambiare (Veronica con le sue questioni sulla fiducia e Logan con il suo bisogno di proteggerla nonostante i desideri della ragazza) e che sarebbe meglio troncare subito invece di proseguire la relazione per molto tempo. Logan confida comunque a Veronia che per lei lui ci sarà sempre. Veronica è profondamente sconvolta e decide così di tornare a casa. Quando Logan capisce che Mercer era l'unico che aveva attaccato Veronica, decide di farsi mettere in prigione apposta per poter essere nella stessa cella del ragazzo e poter così vendicarsi.
Logan e Veronica passarono sei settimane divisi. Durante la loro separazione, Dick cercò di aiutare Logan portantolo sulla spiaggia e facendolo incontrare con un gruppo di ragazze. In seguito Veronica si presenta da Logan e i due si baciano realizzando che entrambi sentono la mancanza dell'altro e tornando così ad essere nuovamente una coppia. Nell'episodio successivo Logan rivela a Veronica di aver avuto una piccola relazione mentre non erano insieme. Veronica scopre in seguito che la ragazza con cui Logan ha dormito ad Aspen è Madison Sinclair e si infuria. Questa volta la gelosia sessuale a un'avversione a perdonare e dimenticare pone fine alla loro relazione.
Logan si trasferisce a parker Lee mentre Veronica fa lo stesso con Stosh "Pish" Piznarski. La serie finisce con Logan e Veronica che condividono il loro ultimi sguardo ambiguo lasciando la loro relazione irrisolta.
Titolo: Logan Echolls (Jason Dohring) 
si distinguono dalla massa di coppie super sdolcinate...e anche per problemi però le battono tutte... 
